Toda la vida ha sido el apellido del padre, pues ahora no lo vas a cambiar, y menos que algún niño si, otro no..... Eso es un lío, no es práctico y crea confusión.
Otra cosa es que desde el principio de los apellidos se debió poner el de la progenitora primero, que seguro que el bebé es de la progenitora, del supuesto padre habría que verlo