Soy ingeniero y aficionado a la música. Como preguntas escueto, te respondo escuetamente.
si tenemos un bunker, ¿nos lo pueden derruir con la frecuencia de resonancia?
En teoría sí.
En la práctica es algo que es seguramente imposible.
¿todo objeto tiene una frecuencia de vibracion?
Una frecuencia de resonancia, sí. Eso de "frecuencia de vibración" no está bien expresado.
¿si pegas con pegamento dos objetos, solo hay una frecuencia?
En teoría sí, pero depende del pegamento y de mil cuestiones físicas más, a lo mejor el objeto puede responder como dos objetos.
Seguramente el objeto puede tener algo así como dos centros de masas, unidos por el pegamento.
En teoría sólo tiene uno, en la práctica es más complejo.
Lo de romper un vaso de agua, ¿por que no se ve con mas frecuencia lo de romperlo?
¿por que la frecuencia es muy alta?
Por eso, por el material (no es lo mismo el vidrio que el cristal) y porque para que el asunto tenga el efecto que buscas hay que emitir la nota con mucha pureza, y eso sólo lo pueden hacer cantantes muy entrenados.
Una nota musical emitida por un humano (o por un instrumento) no se compone de una única frecuencia, sino de muchas, solapadas entre sí.
Esto se ve muy bien en cualquier espectrómetro. Lo puedes ver en tu ordenador.
Graba una nota, un "laaaaaaaaaa", pásalo por el espectrómetro y verás una montaña muy grande (una frecuencia) y un poco a la derecha otra, y luego otra, y luego otra.
Está la frecuencia fundamental y múltiplos de ellas, a menudo llamadas frecuencias armónicas.
También hay frecuencias por debajo, a menudo llamadas frecuencias subarmónicas.