La historia genética de Francia.
Por Bernard Sécher, miércoles 24 de julio de 2019. Enlace permanente Genética de poblaciones
Francia ha sufrido sucesivas migraciones de población: llegada de cazadores-recolectores, granjeros neolíticos y pastores de las estepas. Luego, durante la Edad del Hierro, hubo expansiones celtas seguidas de integración en el Imperio Romano, luego por migraciones germánicas. La posición de Francia en el extremo oeste de Europa lo ha convertido en un destino final para una serie de movimientos de población, pero también una etapa hacia las Islas Británicas y la Península Ibérica.
Geográficamente, Francia está limitada por el Canal de la Mancha al norte, el Océano Atlántico al oeste, los Pirineos y el Mar Mediterráneo al sur, los Alpes y el Rin al este.
Un estudio genético previo se centró en el oeste de Francia mientrasde este estudio se llevó a cabo en 2015.
Aude Saint Pierre y sus colegas acaban de publicar un artículo titulado: La historia genética de Francia . Estudiaron el genoma de más de 2.000 franceses de dos cohortes: los tres citados (3C: 770 individuos) y Suvimax (1414 individuos).
Los autores utilizaron por primera vez el software fineStructure para estudiar la estructura genética de Francia. El resultado identificó 17 grupos para la cohorte 3C y 27 grupos para la cohorte Suvimax. Estos diferentes grupos están fuertemente correlacionados con la geografía, lo que indica una importante estructura genética local. El eje principal de la variación genética es un eje norte / sur. Si forzamos los resultados a obtener solo dos grupos genéticos, separamos el suroeste del resto de Francia. En un nivel ligeramente más fino, obtenemos 6 grupos para 3C y 7 grupos para Suvimax. En la figura siguiente, SW corresponde al grupo suroeste, SW al sur, CTR al centro, NW al noroeste, NW al norte, SE al sureste:
El séptimo grupo para Suvimax incluye un solo individuo que fue eliminado en el resto del estudio.
El grupo del sudeste se identifica solo para la cohorte Suvimax, que en realidad tiene una mejor cobertura de esta región que el proyecto de las tres ciudades. Los dos grupos más importantes para las dos cohortes son los del centro y el norte, que permanecen en gran parte intactos incluso cuando el número de grupos se refina a 17 y 27 para las dos cohortes.
Curiosamente, las fronteras de estos grupos genéticos siguen dos ríos principales: el Loira y el Garona. En una escala más fina, el río Adour también hace posible separar los grupos del suroeste y del sur en la cohorte 3C:
En los dos conjuntos de datos, la diferenciación genética más fuerte se encuentra entre el grupo suroeste y los demás.
Los resultados del análisis con el software ADMIXTURE confirman los resultados obtenidos con fineStructure. Para K = 2, el grupo suroeste muestra un componente mayoritario de tonalidad azul claro que es mucho menos común en los otros grupos genéticos. Para K = 3, aparece un tercer componente verde claro que predomina en el norte y está ausente en el suroeste para la cohorte 3C. En la cohorte Suvimax, este tercer componente es mayoritario en el grupo sureste. Para K = 6, las dos cohortes esencialmente diferencian los grupos del suroeste y el del noroeste:
Luego, los autores utilizaron el software EEMS para resaltar posibles barreras genéticas: las
dos cohortes identifican una barrera alrededor del suroeste de Francia, pero también una barrera en el noroeste y a lo largo del Loira. Finalmente, se puede identificar otra barrera en el sureste alrededor de los Alpes y la frontera italiana.
Los autores estudiaron los segmentos de EII. Muestran un aumento significativo en el tamaño de la población efectiva en las últimas 150 generaciones en Francia. Sin embargo, hay una disminución visible entre las generaciones 22 y 12 (años 1300 a 1700) cuyo comienzo parece coincidir con la aparición de la peste de color en la Edad Media:
Luego, los autores estudiaron las relaciones entre los grupos genéticos franceses y las poblaciones europeas vecinas utilizando datos del proyecto 1000 genomas. Así, la herencia británica está más marcada en el noroeste (Bretaña: 74%) y en el norte de Francia (63%). La herencia italiana contribuye principalmente al sudeste y la herencia ibérica contribuye principalmente al sudoeste.
L'histoire génétique de la France - Généalogie génétique
The genetic history of France
Por Bernard Sécher, miércoles 24 de julio de 2019. Enlace permanente Genética de poblaciones
Francia ha sufrido sucesivas migraciones de población: llegada de cazadores-recolectores, granjeros neolíticos y pastores de las estepas. Luego, durante la Edad del Hierro, hubo expansiones celtas seguidas de integración en el Imperio Romano, luego por migraciones germánicas. La posición de Francia en el extremo oeste de Europa lo ha convertido en un destino final para una serie de movimientos de población, pero también una etapa hacia las Islas Británicas y la Península Ibérica.
Geográficamente, Francia está limitada por el Canal de la Mancha al norte, el Océano Atlántico al oeste, los Pirineos y el Mar Mediterráneo al sur, los Alpes y el Rin al este.
Un estudio genético previo se centró en el oeste de Francia mientrasde este estudio se llevó a cabo en 2015.
Aude Saint Pierre y sus colegas acaban de publicar un artículo titulado: La historia genética de Francia . Estudiaron el genoma de más de 2.000 franceses de dos cohortes: los tres citados (3C: 770 individuos) y Suvimax (1414 individuos).
Los autores utilizaron por primera vez el software fineStructure para estudiar la estructura genética de Francia. El resultado identificó 17 grupos para la cohorte 3C y 27 grupos para la cohorte Suvimax. Estos diferentes grupos están fuertemente correlacionados con la geografía, lo que indica una importante estructura genética local. El eje principal de la variación genética es un eje norte / sur. Si forzamos los resultados a obtener solo dos grupos genéticos, separamos el suroeste del resto de Francia. En un nivel ligeramente más fino, obtenemos 6 grupos para 3C y 7 grupos para Suvimax. En la figura siguiente, SW corresponde al grupo suroeste, SW al sur, CTR al centro, NW al noroeste, NW al norte, SE al sureste:
El séptimo grupo para Suvimax incluye un solo individuo que fue eliminado en el resto del estudio.
El grupo del sudeste se identifica solo para la cohorte Suvimax, que en realidad tiene una mejor cobertura de esta región que el proyecto de las tres ciudades. Los dos grupos más importantes para las dos cohortes son los del centro y el norte, que permanecen en gran parte intactos incluso cuando el número de grupos se refina a 17 y 27 para las dos cohortes.
Curiosamente, las fronteras de estos grupos genéticos siguen dos ríos principales: el Loira y el Garona. En una escala más fina, el río Adour también hace posible separar los grupos del suroeste y del sur en la cohorte 3C:
En los dos conjuntos de datos, la diferenciación genética más fuerte se encuentra entre el grupo suroeste y los demás.
Los resultados del análisis con el software ADMIXTURE confirman los resultados obtenidos con fineStructure. Para K = 2, el grupo suroeste muestra un componente mayoritario de tonalidad azul claro que es mucho menos común en los otros grupos genéticos. Para K = 3, aparece un tercer componente verde claro que predomina en el norte y está ausente en el suroeste para la cohorte 3C. En la cohorte Suvimax, este tercer componente es mayoritario en el grupo sureste. Para K = 6, las dos cohortes esencialmente diferencian los grupos del suroeste y el del noroeste:
Luego, los autores utilizaron el software EEMS para resaltar posibles barreras genéticas: las
dos cohortes identifican una barrera alrededor del suroeste de Francia, pero también una barrera en el noroeste y a lo largo del Loira. Finalmente, se puede identificar otra barrera en el sureste alrededor de los Alpes y la frontera italiana.
Los autores estudiaron los segmentos de EII. Muestran un aumento significativo en el tamaño de la población efectiva en las últimas 150 generaciones en Francia. Sin embargo, hay una disminución visible entre las generaciones 22 y 12 (años 1300 a 1700) cuyo comienzo parece coincidir con la aparición de la peste de color en la Edad Media:
Luego, los autores estudiaron las relaciones entre los grupos genéticos franceses y las poblaciones europeas vecinas utilizando datos del proyecto 1000 genomas. Así, la herencia británica está más marcada en el noroeste (Bretaña: 74%) y en el norte de Francia (63%). La herencia italiana contribuye principalmente al sudeste y la herencia ibérica contribuye principalmente al sudoeste.
L'histoire génétique de la France - Généalogie génétique
The genetic history of France
